Ирина62, по мне, черные пятна похожи на сажистый грибок. Коричневые похожи на ржавчину, но на орхидеях ее еще не видела. Конечно, с растениями такая штука - никогда не знаешь, как лучше. Оставить так, как есть, или резать. Я режу только если мокрая гниль. В остальных случаях даю растению возможность самому справиться с болячкой. Конечно, помогая ему обработками от грибка. Но раз Вы уже порезали...
В темноту я бы точно не ставила - свет нужен растениям для жизни. Растение и так ослаблено дорогой, манипуляциями, а тут Вы его еще и лишите "питания". Точно загнется. На прямое солнце, конечно, нельзя ставить. Но свет точно нужен. Что с корневой не понятно, достаточно ли корней для питания. Но судя по тому, что турогор был в норме до того, как Вы его вытащили - ему их хватало. Сейчас, если вытащили из привычной ему среды, корни могут усохнуть и тогда будет дизбаланс между листьями и корнями. Растению еще нужно будет нежаркое место, чтобы не терять влагу, ну и не холодное, что не провоцировать дальнейшее распространение болезни, без сквозянков и больших перепадов темп-р.