То, что гниль вычистили это правильно. Но вот отрезать корни не нужно, они могут быть живыми и вполне функционирующими, несмотря на неприглядный вид.
Листья я обычно тоже не отрезаю никакие, пока сами не отвалятся (если только там не явная бяка, конечно). Потому что растения только что пережило жестокий стресс - перевозку из одних условий в кардинально другие, и таким образом оно пытается минимизировать для себя последствия, а именно - не тратить силы на рост новых корней и листьев, воспользовавшись имеющимися запасами. Отсюда и пожелтевшие листья и прочее. Гниль это уже атака со стороны на ослабевшее растение. В общем моё резюме - по приходу я всегда осматриваю растение, обрабатываю от вредителей, вычищаю гниль, если обнаруживаю, но ничего не обрезаю "просто некрасивого". Просто создаю максимально комфортные условия и не трогаю, пока растение не придёт в себя. Ну и наблюдаю. чтобы гниль снова не появилась.